Je wordt gevraagd om je wereld te bezoeken door een klein rood wezen met een ronde vorm. Hij leeft in een kleine wereld, bestaande uit platforms, vergelijkbaar met onderbroken zwarte lijnen. Alles was in orde tot het moment dat paarse ballen op de perrons begonnen te verschijnen. Aanvankelijk vermoedde niemand iets ergs, maar toen ze erachter kwamen, bleek dat deze paarse ballen niets meer zijn dan slakken. Ze zwerven door de werelden en vangen ze en veranderen ze in lege onbewoonde ruimtes. Help de held van Color Balls Of Goo zich te ontdoen van schadelijke aliens. Om dit te doen, moet je opspringen en ze aanraken. Probeer tegelijkertijd niet in de platforms te vallen. Zodra alle naaktslakken zijn geëlimineerd, verschijnt er een cirkelvormig portaal om naar het volgende niveau in Color Balls Of Goo te gaan.
