Water of een andere vloeistof, die de wetten van de zwaartekracht volgt, zal naar beneden stromen als het een uitweg vindt, zelfs een klein scheurtje. In Water Flow 3D moet je het vrij laten stromen om de vierkante containers hieronder te vullen. Het aantal containers varieert, maar u moet niet vergeten dat u er alleen vloeistof van de overeenkomstige kleur in kunt gieten. Open hiervoor de luiken in de juiste volgorde. Soms moet je vloeistoffen mengen en glazen wanden breken met zware ballen in Water Flow 3D. Er zijn veel niveaus en ze zijn divers in het instellen van taken.