Ninja's staan bekend om hun springvermogen, zelfs zonder speciale uitrusting, maar wat gebeurt er als je een behendige ninja voorziet van een speciale springstok. In Hopping Ninja moet je erachter komen. De held heeft een pogo stick-jumper tot zijn beschikking. Dit vervoermiddel is nieuw voor de held en hij heeft nog geen tijd gehad om het onder de knie te krijgen. Je helpt de ninja door de levels te komen met behulp van de jumper om obstakels te overwinnen. Door op de held te klikken, laat je hem springen, terwijl het belangrijk is om op een stok te landen, en niet op zijn hoofd. Kantel de stok naar voren om te bewegen in plaats van op zijn plaats te springen. In het begin zal het een beetje moeilijk zijn, maar je zult wennen aan Hopping Ninja.
