Mario, een loodgieter waar we allemaal van hielden, raakte geïnteresseerd in een straatsport als parkour. Onze held besloot zichzelf in deze sport te trainen op de daken van stadsgebouwen. Jij in Super Mario City Run gaat met hem mee in deze training. Voor je op het scherm zie je Mario op het dak van het huis staan. Onder jouw begeleiding zal hij geleidelijk naar voren rennen en snelheid opvoeren. Kijk goed naar het scherm. Op de weg van je held zullen er mislukkingen zijn die de daken van gebouwen scheiden. Als hij op een bepaalde afstand naar een van hen toe rent, moet je hem laten springen. Zo springt je held over dit gevaar heen. Er verschijnen ook obstakels voor Mario. Op sommige van hen zal hij op de vlucht kunnen klimmen, onder andere, integendeel, hij zal op zijn rug onder de bodem moeten rijden. Onderweg moet Mario verschillende items oppikken die je punten opleveren en de held verschillende soorten bonussen kunnen geven.
