Hoog in de bergen in de wereld van Minecraft is een tempel waar ninjastrijders worden getraind. Ooit werd het binnengevallen door soldaten van de koninklijke garde. Jij in het spel Noob Ninja Guardian zal je held moeten helpen de tempel te beschermen tegen de soldaten. Een bepaalde locatie waar je personage zich zal bevinden, zal zichtbaar zijn op het scherm voor je. Soldaten van het vijandelijke leger zullen in zijn richting bewegen. Je gebruikt de muis om de acties van je held te besturen. Je zult tegenstanders moeten aanvallen. Door een reeks stoten en trappen toe te brengen, vernietig je de vijand en krijg je er punten voor. Met elk niveau van tegenstanders zal meer en meer worden. Kijk daarom goed om je heen en verzamel wapens die op de locatie zullen verschijnen. Hiermee vernietig je snel en efficiënt vijanden.