Er gebeurt constant iets in de natuur, levende wezens en planten evolueren, afhankelijk van de veranderingen in de omringende wereld. Evolutie verloopt langzaam, geleidelijk en niet voor jaren, maar voor eeuwen. Maar in het spel Evolution Simulator 3D kun je alles aanzienlijk versnellen. Om te beginnen maak je een insect dat je onder controle zult houden. Ga na het vormen van het beeld op reis. Verzamel eetbare planten en paddenstoelen, fruit enzovoort om te groeien en zich te ontwikkelen. Verder kun je zelfs andere insecten aanvallen, maar die moeten veel kleiner zijn in Evolution Simulator 3D.