Een kleine eekhoorn genaamd Thomas gaat vandaag op reis. Onze held wil zijn voedselvoorraad aanvullen. Jij in het spel Squirrel Hop zal hem helpen in dit avontuur. Voordat je op het scherm verschijnt, is je personage zichtbaar, die de afgrond van de ene naar de andere kant moet oversteken. De brug die ooit over de afgrond leidde, werd vernietigd, maar houten palen bleven over. Je zult ze gebruiken om de held van de ene naar de andere kant te vervoeren. Gebruik hiervoor de bedieningstoetsen om je eekhoorn een bepaalde afstand te laten springen. Zo zal hij van de ene stapel naar de andere springen en geleidelijk vooruit gaan. Onderweg kan je held overal noten verzamelen. Voor elk item dat je in het spel oppakt, ontvangt Squirrel Hop punten.