Je held in Run Race 3D is een rode stickman die zal racen. Zijn rivalen zijn gele, groene en blauwe stickmen. Ze moeten worden ingehaald, waarbij ze elk spoor op het niveau drie keer passeren. In een rechte lijn zal je loper alleen rennen, maar als het gaat om springen om moeilijke overgangen te overwinnen, moet je hier je atleet helpen, anders blijft hij uitglijden voor een obstakel. Door op de held te klikken, laat je hem springen en geef je zo de mogelijkheid om het obstakel te passeren. Probeer meteen vooruit te komen, anders wordt het moeilijker om rivalen in te halen die bijna op één rij rennen in Run Race 3D.