Een gele stickman genaamd Tom zit in ernstige problemen in Run Tom - Escape. Door de breking van de ruimte werd hij getransporteerd naar een parallelle wereld. Alles zou in orde zijn, maar er wordt gejaagd op dergelijke kolonisten, en over het algemeen bleek de wereld een nogal gevaarlijke plek te zijn, het zit vol met vallen en andere problemen. Tom moet zorgvuldig verschillende locaties doorzoeken om de items te verzamelen die nodig zijn om naar huis terug te keren. Gewapende locals zullen onderweg op je held wachten, en jij, die met hen de strijd bent aangegaan, zult de vijand hiervoor moeten vernietigen met je wapens. Voor elke gedode vijand krijg je punten in het spel Run Tom - Escape, en je kunt ook trofeeën pakken die eruit zijn gevallen en het voor jezelf gemakkelijker maken om het spel te halen.