Twee renners zullen de baan betreden in het Magic Run 3D-spel en jij zult een van hen besturen om hem te helpen winnen, en jij om het niveau te halen. Je held zal alleen door het eerste niveau gaan, omdat je je op je gemak moet voelen en begrijpen hoe je moet handelen en wat je moet gebruiken. Wanneer je het volgende obstakel nadert, klik je op de held zodat hij op magische wijze transformeert en het gemakkelijk passeert. In het ene geval heeft hij kracht nodig en in het andere geval behendigheid. Om hoge muren te beklimmen of ondersteboven te rennen. Na het behalen van het trainingsniveau ben je klaar voor de competitie en ga je daarna niet geeuwen in Magic Run 3D.
