De piraten kregen iedereen te pakken en zelfs de ninja's verloren hun geduld en besloten de aanmatigende zeerovers te straffen. Een team ninja's legt een hinderlaag op een van de eilanden waar piraten regelmatig hun gestolen schatten proberen te verbergen. In het spel Angry Ninja help je de ninja om de piraten te vernietigen. De schurken zullen proberen versterkingen te bouwen en zich erachter te verstoppen, maar jouw nauwkeurige schoten zullen alles op hun pad wegvagen. Het spel Angry Ninja is gemaakt in de stijl van Angry Birds, maar in plaats van hen en varkens, totaal andere karakters. Ninja's worden zelf projectielen en je lanceert ze naar de piraten die zich achter verschillende soorten balken in Angry Ninja verstopten.