Gewoonlijk wordt water of een andere drank in een beker gegoten, maar in het spel Cups and Balls vul je deze met kleurrijke ballen. Onder de beker zie je een digitale waarde, tijdens het vullen van de beker moet deze nul worden. Dit is een signaal om het niveau te halen en naar een nieuw niveau te gaan. Om dit te doen, moeten de ballen toegang hebben tot de beker en hiervoor kun je speciale touwen spannen die roze kruisen verbinden. Als er bommen op het veld verschijnen, moeten deze ook worden geneutraliseerd met behulp van uitgestrekte touwen. Als er een explosie is, zal het niveau mislukken. Nieuwe levels zullen je andere verrassingen bieden, de taken zullen moeilijker worden in Cups and Balls.