Tijdens het uitvoeren van verkenningen viel de ninja-krijger in een val en was in staat om de samoerai te vangen. Onze held kon uit de kooi komen en nu zal hij moeten ontsnappen. Jij in het spel Ninja Escape zal de ninja helpen in dit avontuur. Voor je zal je personage zichtbaar zijn op het scherm, dat geleidelijk aan snelheid zal maken en langs de weg zal rennen. Onderweg zullen er obstakels en vallen zijn die je held snel moet overwinnen. Ook op de weg van de ninja zullen er samoerai zijn die je held willen vernietigen. Jij, die een arsenaal aan verschillende werpwapens gebruikt, moet ze naar de vijand gooien. Wanneer je vijanden raakt, vernietig je ze en krijg je hiervoor een bepaald aantal punten in het Ninja Escape-spel.
