Een man genaamd Tom erfde een kleine fabriek die in verval was. Onze held besloot het te gaan ontwikkelen. In het spel Mega Factory help jij hem hierbij. Je personage zal voor je op het scherm zichtbaar zijn, die zich in een van de fabrieksgebouwen zal bevinden. Het eerste dat u moet doen, is er doorheen lopen en alles zorgvuldig bekijken. Je zult gouden munten moeten verzamelen die verspreid over de vloer van de kamer liggen. Vervolgens ga je de fabrieksapparatuur in bedrijf stellen. Ze zal producten gaan produceren die je moet verpakken. Vervolgens laad je het product op een vrachtwagen die het bij de klanten aflevert. Hiervoor ontvang je geld. Je kunt ze besteden aan de aanschaf van nieuwe apparatuur voor de fabriek, grondstoffen voor het werk en het inhuren van personeel. Dus geleidelijk aan organiseer je in het spel Mega Factory het werk van de fabriek.
