Een armada van buitenaardse schepen is aangekomen op de planeet waar de kolonie aardbewoners zich bevindt. Ze willen de hele planeet overnemen en de kolonie vernietigen. Jij in het spel Swarm Defense: Planetary Invasion zal zijn verdediging leiden. Voor je op het scherm zie je het gebied waarin de nederzetting van aardbewoners zich bevindt. In zijn richting zullen de aliens langs de weg bewegen. Je zult alles heel zorgvuldig moeten onderzoeken en vervolgens, met behulp van een speciaal paneel, verdedigingstorens en constructies op strategisch belangrijke plaatsen moeten plaatsen. Wanneer de buitenaardse wezens hen naderen, openen je soldaten het vuur vanuit deze gebouwen om te doden. Door nauwkeurig te schieten, vernietig je je tegenstanders en hiervoor krijg je punten. Op hen kun je in het spel Swarm Defense: Planetary Invasion een nieuw wapen kopen en nieuwe verdedigingsstructuren upgraden of bouwen.