Het lijkt erop dat vleermuizen voor Batman vrienden hadden moeten worden, of op zijn minst helpers, maar dit zal niet het geval zijn in Batman cool. De muizen die de held zullen aanvallen, werden blootgesteld aan schadelijke straling, die hun kleine hersenen corrigeerde en vrienden in gezworen vijanden veranderde. De superheld probeerde de muizen te repareren, maar faalde. Hij installeerde een speciaal kristal dat golven uitzond, maar die werkten niet. En als dat zo is, kan hetzelfde kristal verbitterde knaagdieren vernietigen. Jouw taak in Batman cool is om schoten op doelen te richten en onderweg muizen te vernietigen.
