De dierentuinhouder stond 's ochtends op en begon aan de traditionele rondleiding door de dieren en was verbaasd over wat hij zag - alle dieren en vogels waren verdwenen. Wanhopig haastte hij zich om te zoeken, maar hij weet niet waar hij moet kijken, dus ging hij gewoon door in Timekeepers. Onderweg ontmoette hij een vreemde persoon die zichzelf voorstelde als Dr. Lunasi. Het blijkt dat hij de slechterik is die alle dieren heeft ontvoerd. Zie je, hij zette een experiment op, testte zijn nieuwe tijdmachine, en de straal die rechtstreeks naar de dierentuinen werd gestuurd, alle bewoners werden naar een parallelle wereld getransporteerd. De slechterik nodigt de conciërge uit om daarheen te gaan en zijn dieren te redden, en jij helpt hem in Timekeepers.
