Een nieuwsgierige pinguïn zat op een roze walvis en zwom ver de zee in, en toen hij naar huis wilde terugkeren, blokkeerden ijsblokken zijn weg naar Penguin Extreme Puzzle. Hoe sterk de walvis ook is, hij kan de blokken niet uit elkaar duwen, ze zijn enorm, meerdere malen groter dan de walvis. Daarom moet je de pinguïn en zijn vriend helpen door alle niveaus te gaan en de weg vrij te maken voor elke vriend. Verplaats de blokken en als de weg vrij is, klik je op de pinguïn en hij zal veilig naar een nieuw niveau gaan, dat zeker moeilijker zal zijn dan het vorige in Penguin Extreme Puzzle.