In het tweede deel van het Ninja Hands 2-spel blijf je je ninjaoorlog helpen vechten tegen verschillende tegenstanders die hem willen doden. Je jager zal voor je op het scherm zichtbaar zijn, die zich op een bepaalde locatie zal bevinden. De vijand zal op een afstand van hem zijn. In de rechter benedenhoek is er een speciaal paneel met pictogrammen. Door erop te klikken, kun je de held dwingen om bepaalde acties uit te voeren. Je zult je tegenstander moeten aanvallen en je gevechtsvaardigheden moeten gebruiken om de vijand te vernietigen. Hiervoor krijg je punten in het spel Ninja Hands 2.
