Een woestijn is een gebied met barre weersomstandigheden. Overdag is het hier ondraaglijk warm en 's nachts verschrikkelijk koud. Parkour doen op een plek als deze is zelfmarteling. Daarom rent de held in 3D Desert Parkour niet uit eigen vrije wil op volle snelheid door een zandvallei. Hij moet zijn eigen mensen bereiken via het gebied waar onlangs veldslagen hebben plaatsgevonden en er mogelijk wordt geschoten. De held zal snel rennen, maar onderweg kan hij betonnen barrières, kapotte tanks en zelfs laservallen tegenkomen. Door de pijlen te besturen, moet je de held dwingen obstakels behendig te overwinnen, waarna hij ver kan rennen in 3D Desert Parkour.
