De jonge samurai heeft een belangrijke taak gekregen en die wil hij zo snel en zo goed mogelijk volbrengen om zichzelf te bewijzen en te laten zien dat hij iets waard is. Je zult het doel van zijn missie niet kennen, het is geheim, maar bij Samurai-run hangt het van jou af of de held zijn doel zal bereiken. Om op tijd te zijn, zal de held de hele tijd rennen, zonder naar zijn voeten te kijken. Het is jouw taak om te voorkomen dat hij in een gat valt of ontploft op een bom, die veel op de platforms zal staan. De held kan niet alleen snel rennen, maar ook hoog springen en zelfs een beetje zweven, dankzij zijn mantel, en deze als parachute gebruiken. Zorg er bij het landen voor dat het gebied vrij is van bommen en andere gevaarlijke objecten waarop Samurai draait.
