De held van het spel Final Ninja beschouwt zichzelf als de laatste ninja in zijn soort. De vijandige clan slaagde erin alle familieleden van de held uit te roeien, maar hij zal niet opgeven. Zelfs als hij moet sterven, is hij van plan al zijn vijanden mee te nemen. In de tussentijd moet je het hol van vijanden vinden en om dit te doen zul je veel obstakels moeten overwinnen. Gebruik de pijlen om te bewegen en door op de muisknop te klikken, gooi je de shurikens weg. Als je de sleutel ingedrukt houdt tijdens het gooien, kun je jezelf vastgrijpen en naar hogere platforms trekken waar je in Final Ninja niet naartoe kunt springen.