Een team van dappere onderzoekers vertrekt op een ruimteexpeditie om bevriende beschavingen te vinden in de Bubble Throw. Tijdens de vlucht kwam een bepaalde vijandige substantie het schip binnen, die werd aangevuld met veelkleurige bubbels en het schip van binnenuit dreigt te veroveren. De helden ontdekten dat ze de invasie kunnen bestrijden met ballen van dezelfde kleur door ze te gooien en groepen van drie of meer identieke ballen te maken die ze vervolgens kunnen vernietigen. Om een level in Bubble Throw te voltooien, moet je het vereiste aantal punten scoren. Er zijn in totaal vijftig niveaus in het spel en de complexiteit ervan neemt gestaag toe.
