Op een afgelegen eiland ergens in de oceaan, ver weg van nieuwsgierige blikken, bevindt zich een geheim laboratorium waar experimenten op genetisch niveau worden uitgevoerd. Hier in Merge Animals - Mutant Fight worden monsters gemaakt en jij doet mee aan hun creatie. Een volwaardig monster moet er intimiderend uitzien en voor zichzelf kunnen opkomen, dus nadat de mutant is gemaakt, moet deze worden getest. Je creatie zal een duel moeten aangaan met een andere mutant, en als je keuze uit verschillende onderdelen: hoofd, romp, poten, hoorns, enzovoort succesvol is, zal je monster winnen. Na elke overwinning worden er nieuwe reserveonderdelen aan het spaarvarken toegevoegd om een nieuwe mutant te creëren in Merge Animals - Mutant Fight.
