Het krachtige wapen in Voxel Mega Shooter is ontworpen om de gepixelde monsters te bestrijden die je in elk level zullen aanvallen. Het wapen is behoorlijk wispelturig; het beweegt vanzelf in een horizontaal vlak, en je kunt het alleen een bevel geven om te schieten. Er kunnen ronde obstakels zijn tussen het wapen en het doelwit; deze kunnen je hinderen of helpen. Gebruik ricochet en richt de schoten op het obstakel, zodat de granaten uiteindelijk het monster bereiken en het geleidelijk vernietigen. Zodra de laatste pixel naar beneden valt, krijg je toegang tot een nieuw beeld en verschijnen er nieuwe obstakels in Voxel Mega Shooter.
