Het doel in Boss Hunter Run is om de rode reus te verslaan. Er is nog maar heel weinig over, je hebt de finish al bereikt. De reus trekt zich terug, maar hij is nog steeds sterk en kan niet alleen worden verslagen. Rekruteer daarom meer vechters terwijl je beweegt en door de blauwe poorten met positieve waarden gaat. Probeer rode barrières te vermijden, het monster zal ze opzetten en proberen je team te vertragen. Dit zijn niet alleen gewone blokken, maar ook rode ballen met stekels. Wees voorzichtig en reageer snel op hun uiterlijk. Aan de finish zal er een laatste gevecht zijn, omdat de reus zich nergens kan terugtrekken. Als je leger talrijk is, kun je de vijand gemakkelijk verslaan in Boss Hunter Run.