Om de een of andere reden zijn de meeste buitenaardse wezens die in de speelruimtes aankomen, bezig met het ontvoeren van huisdieren: schapen of koeien. Het spel Paper UFO zal geen uitzondering zijn. Je bestuurt een vliegende schotel om een koe op te pakken en naar een speciaal portaal te vervoeren dat het dier naar een andere planeet zal sturen. Wanneer je op een buitenaards schip klikt, verschijnt er een verticale straal, gericht naar de grond. Als een dier erin stapt, begint het omhoog te komen. Ondertussen begin je de plaat te bewegen om de koe te verplaatsen, waarbij je alle gevaarlijke obstakels passeert en het portaal bereikt in Paper UFO.
