Het plannen van gevechten in Ninja Wars: Battle Simulator verandert het bevel voeren over een leger in een test van je tactieken en je vermogen om op tijd voor het begin van de strijd van squad-formatie te wisselen. Je moet krijgers verzamelen en proberen de strijdkrachten van de vijand in elke fase van dit strategische proces snel te analyseren. Houd de locatie van de boogschutters nauwlettend in de gaten en zet speerwerpers op tijd in om te voorkomen dat de flanken doorbreken en snel de vijandige ninja-troepen te verslaan. Voor elke overwinning en succesvolle verovering van posities in Ninja Wars: Battle Simulator krijg je spelpunten. Een snelle reactie op vijandelijke manoeuvres en een correcte berekening van de omvang van het leger zullen je helpen de toenemende complexiteit van gevechten het hoofd te bieden. Jouw vermogen om de acties van verschillende soorten troepen vakkundig te coördineren zal de sleutel zijn tot je militaire triomf.