In het spel Cute Pony Puzzle Quest wacht een magische, kleurrijke wereld van pony's op je. Kleine paarden zijn altijd welkome karakters geweest en zullen dat ook blijven in elk spel. Met hun deelname willen alleen maar meer mensen spelen. Dit spel bestaat uit een set van negen puzzels. Je kunt ze één voor één verzamelen door de sloten op de foto's te openen. De stukjes waaruit de puzzel bestaat, hebben dezelfde vierkante vorm. Nadat je de volgende foto hebt ontvangen, zul je zien hoe deze in vierkante stukken uiteenvalt, en het is jouw taak om ze terug te geven en op hun plaats te zetten in Cute Pony Puzzle Quest.