De rode en blauwe stippen willen elkaar ontmoeten, maar ze hebben geen armen of benen waarmee ze kunnen bewegen, maar de stippen zijn rond, wat betekent dat ze kunnen rollen. Je moet een magisch potlood en je vindingrijkheid gebruiken. Om de stippen dichter bij elkaar te krijgen, tekent u een lijn of vorm zodat de ballen naar beneden rollen en tegen elkaar botsen. Doorloop de niveaus, de eerste zes zijn al beschikbaar en je kunt er een kiezen, zonder de volgorde te volgen, je moet alles doorlopen om toegang te krijgen tot de overige niveaus in Brain Dots.
