Een dunky veulen genaamd Spirit is uitgegroeid tot een prachtig volbloed paard. Eens wist hij van de boerderij te ontsnappen en nu is hij vrij. Hij reist de wereld rond, maakt vrienden en je ontmoet hem in Horse Run 3D, waar hij een schattig meisje ontmoette en ermee instemde om een u200bu200btijdje zelf te rijden om het meisje te helpen ontsnappen aan haar slechte stiefmoeder. Help de helden, het paard zal door de smalle straatjes van een klein stadje moeten rennen. Onderweg kom je verschillende obstakels tegen die je moet vermijden of waar je overheen moet springen, verzamel munten en appels om de kracht van het dier aan te vullen.