Tijdens het verschijnen van Covid begon de bevolking van de planeet verwoed virussen te bestrijden en racete ze om nieuwe vaccins te maken. Tijdens de paniekrace zijn velen echter vergeten dat niet alle virussen zo schadelijk zijn. Velen van hen zijn erg nuttig en ons lichaam kan niet zonder hen. In The Flappy Virus help je een nuttig virus om aan gevaarlijke vaccinatieschoten te ontsnappen. Ze zijn dodelijk voor hem, en hij wil, net als elk levend wezen, overleven. Door op het personage te klikken, laat je hem hoger en lager vliegen. Dat is op een bepaald niveau. Omzeil de spellen met scherpe injectiespuiten, ze steken niet alleen van onderen uit, maar ook van bovenaf in The Flappy Virus.
