Seizoensgevechten beginnen in Naruto Free Fight: Seizoen 2. De strijd aangaan: Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha en Kakashi. Kies een held die je gaat helpen om rivalen te verslaan en je wordt overgebracht naar de locatie waar de strijd direct zal beginnen. Meerdere vijanden zullen je personage tegelijk aanvallen. Ze komen één voor één naar boven, dan in groepjes. Met behulp van de ZX-toetsen moet je de jager dwingen aanvallen af te slaan, en het is beter om jezelf aan te vallen en vooruit te gaan, bonussen te verzamelen en levels te halen. Raak je tegenstanders met precieze stoten en trappen. Gebruik je speciale vaardigheden alleen in extreme gevallen, wanneer er te veel vijanden zijn in Naruto Free Fight: Seizoen 2.