De broers waren onafscheidelijk en kozen allebei voor het militaire beroep. Samen voerden ze verschillende missies uit, elkaar helpend en ondersteunend. Maar onlangs moesten ze uit elkaar en een van de broers werd vermist tijdens een missie. De held van het spel Super Jump Bros gelooft niet dat zijn broer dood is, hij besloot hem te gaan zoeken. Om het pad te verkorten, moet hij door landen gaan die worden bewoond door verschillende monsters, waaronder skeletten en zombies. Help de jager, hij kan vijanden raken met een zwaard of bommen naar ze gooien, en ook krachtige straling veroorzaken. Verzamel munten en kristallen, deze kunnen van pas komen in de winkel voor het kopen van speciale wapens in Super Jump Bros.