In Space Shooter Boss wordt een krachtige ruimtejager de ruimte in gestuurd om de grens te beschermen tegen een invasie vanuit de diepten van de ruimte. Boven aan het scherm staat een armada van vijandelijke schepen opgesteld. Maar zij zijn niet de enigen; jachtbommenwerpers kruisen het hele veld door, beschieten intensief de grens en proberen je patrouilleschip te vernietigen. Je moet het eerst vernietigen en dan een rij andere schepen neerschieten in Space Shooter Boss.