De held van het spel Escape the Giant School 3D werd plotseling heel klein en bevond zich in een school die voor hem gigantisch was geworden. Gewone boeken, potloden en een gum zijn obstakels geworden op het pad van de jongen en hij wil snel de gevaarlijk geworden school verlaten. Help hem obstakels te overwinnen in de vorm van enorm briefpapier, schoolboeken en andere items die een student gewoonlijk gebruikt. Spring over gummen en potloden, over boeken en bureaus en bereik de finish om naar een nieuwe locatie in Escape the Giant School 3D te gaan.