De ontsnapping van een klein experimenteel knaagdier uit een labyrintisch wetenschappelijk complex ontvouwt zich vanuit een first-person perspectief in de 3D-game Squeak Lab 3D. Zoek naar heerlijke porties kaas om levensreddende deuren te openen, ren snel weg van een achtervolgend mechanisch roofdier, identificeer de dreiging nauwkeurig aan de hand van de kleur van zijn snor en duik in strakke, levensreddende gaten. Navigeer door gangen die worden geblokkeerd door beweegbare tralies, vind voedzame kruimels voor waardevolle verbeteringen in de pootsnelheid en overwin met succes een reeks unieke labyrinten in Squeak Lab 3D.