De volgende oorlog laaide op in de ruimte en je kunt eraan deelnemen als commandant van een grote vloot. De taak in Battle of Aliens is om volledig en onherroepelijk te winnen. Om dit te doen, moet je een geschikte strategie en tactiek ontwikkelen. Onderaan het paneel is een set schepen met verschillende niveaus van verdediging en aanval. Overwinning hangt af van je keuze. Als je zwakke schepen opzet, zal de vijand ze snel wegvagen, als je meteen de zwaarste en krachtigste jagers stuurt, kun je de verdediging doorbreken, maar het is niet bekend wat je te wachten staat en je hebt niets meer over. Zoek daarom naar een middenweg.